Террорист по имени Имран Захаев мечтает вернуть советские времена в России. Захаев знает, что США никогда не позволит этому случиться, поэтому он финансирует переворот на Ближнем востоке, организованный его союзником Халедом Аль-Асадом, чтобы отвлечь внимание мира от России. Тем не менее, Британское правительство раскрывают планы Захаева.

История рассказывается с перспектив оперативников британской спецслужбы SAS Сержанта МакТавиша и капитана (в одной из миссий — лейтенанта) Прайса, американского морского пехотинца сержанта Джексона, оператора вооружения американского самолёта AC-130 и президента неизвестного ближневосточного государства. Действие игры проходит на сухогрузе, тайно перевозящем оружие (Соуп), в неназванной ближневосточной стране (Джексон), на Кавказе, Северном Азербайджане и в Алтайском крае России (Соуп), и Зоне отчуждения вокруг Чернобыльской АЭС на Украине (лейтенант Прайс, время действия — за 15 лет до основных событий кампании). После прохождения игры доступна миссия «Эпилог» — на борту летящего самолета, протагонист не называется (возможно это Соуп, так как он появляется в игре Modern Warfare 2).